《食灵零》讲述所爱之人，因爱弑杀。故事开始时土宫神乐的母亲刚刚过世，父亲为了继承白叡必须到各地除灵无法分心照顾女儿神乐，于是谏山黄泉就向父亲请命照顾土宫神乐。神乐因此开始跟黄泉住在一起。神乐得知黄泉的工作是兼职于国土环境省里面的退魔师，专门负责清除恶灵。二年后神乐也加入了环境省做兼职。在与黄泉的朝夕相处中，姐妹之情日益加深，而黄泉和环境省的另一个同伴饭纲纪之在父母之命下订了婚。黄泉的表姐谏山冥素来对黄泉不满，觉得黄泉夺走了本该属于自己的地位。而其除灵过程中不幸被A级恶灵三途河和宏所杀，并被赐予杀生石复活，成为了恶灵。以恶灵身份复活后的冥开始了自己的报复和夺权，不久，她便杀死谏山家当主（黄泉的养父），帮自己父亲坐上当主之位，继而剥夺了谏山黄泉的一切。冥对黄泉的嫉恨仍然没有解除，她将失意的黄泉约在郊外，将杀害黄泉父亲的事实告诉黄泉刺激黄泉，本想将愤怒的黄泉斩杀，却不料反被黄泉杀死。此后，A级恶灵三途河和宏出现将黄泉打成重伤，全身神经几乎全被切断。 受伤期间，黄泉受到环境省的质疑和调查，又被解除婚姻，未婚夫更是不见踪影，就连神乐也因为怀疑她而流着泪跑出了病房。失去了一切支柱的黄泉被三途河趁虚而入，植入杀生石，堕入了无底的深渊。受杀生石的影响，黄泉无法控制自己开始到处杀戮。她不仅杀死近半的环境省队员，还导致神乐的父亲身负重伤，不治而逝。 黄泉很快成为众矢之的，各路除灵组织和环境省都开始对她进行追杀，就连未婚夫和神乐也必须面对杀死黄泉。 最终，谏山黄泉与继承了土宫家灵兽白叡的土宫神乐终于展开了决战。